Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
A4D1N5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms