Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHRF1Q9P1Y6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHRF1Q9P1Y6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms