Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOMER3Q9NSC5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms