Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM60AQ9NP50 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM60AQ9NP50 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM60AQ9NP50 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FAM60AQ9NP50 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FAM60AQ9NP50 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FAM60AQ9NP50 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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