Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms