Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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USP43Q70EL4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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USP43Q70EL4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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