Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms