Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF123Q5XPI4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms