Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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