Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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