Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHC1P78364 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC1P78364 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC1P78364 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms