Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPL23P62829 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPL23P62829 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL23P62829 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms