Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACTBP60709 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACTBP60709 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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