Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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