Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB27AP51159 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms