Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP8P40818 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP8P40818 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP8P40818 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms