Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms