Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTX2P32243 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms