Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD247P20963 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms