Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms