Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LYVE1Q9Y5Y7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms