Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP164Q9UPV0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms