Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms