Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BICD1Q96G01 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms