Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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