Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms