Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms