Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms