Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms