Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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CNGA3Q16281 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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CNGA3Q16281 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNGA3Q16281 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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