Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEA1Q15075 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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