Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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BECN1Q14457 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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