Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms