Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ABCE1P61221 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms