Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTTPP55157 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms