Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms