Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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