Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QRK9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QRK9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QRK9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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