Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E9PBE3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms