Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y613

FHOD1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD1Q9Y613 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHOD1Q9Y613 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms