Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms