Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms