Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms