Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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