Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNAPC1Q16533 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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