Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IHHQ14623 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms