Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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EBI3Q14213 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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