Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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