Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms