Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms